使用C#Process运行可执行程序

我是Bioinformatic的人,我使用C#来完成我的工作。 我一直在C#中使用Processes多次运行可执行程序。 这次我有一个新问题。 我在Windows中为一个名为Blast的程序下载了一个exe文件( http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastDocs&DOC_TYPE=Download )。 如果我输入我的命令是:

blastp -query input.txt -db pdbaa -out output.txt 

它工作正常。 但是当我从记事本中复制粘贴命令时会出错。 我搜索了这个问题,发现它是“编码问题UTF-8与ISO-latin”( http://biostar.stackexchange.com/questions/7997/an-error-by-using-ncbi-blast- 2-2-25-on-windows )由复制和粘贴引起。

既然我想从c#运行进程来调用exe文件我得到了同样的问题,我想这是因为这个过程做了像复制和粘贴这样的事情。 这是我的代码:

  public void Calculate() { Process proc = new Process(); proc.StartInfo.WorkingDirectory = Program.NCBIBlastDirectory; proc.StartInfo.FileName = @"C:\Program Files\NCBI\blast-2.2.25+\bin\blastp.exe"; proc.StartInfo.Arguments = "blastp -query input.txt -db pdbaa -out output.txt"; proc.StartInfo.UseShellExecute = false; proc.StartInfo.RedirectStandardError = true; proc.StartInfo.RedirectStandardError = true; proc.Start(); proc.WaitForExit(); proc.Close(); } 

你知道我怎么能解决这个问题吗?

提前致谢。

我能看到的一个问题是你设置Arguments的行:

 proc.StartInfo.Arguments = "blastp -query input.txt -db pdbaa -out output.txt"; 

我想你的意思是:

 proc.StartInfo.Arguments = "-query input.txt -db pdbaa -out output.txt"; 

所以你不需要在Arguments中再次指定可执行文件名 – 这就是FileName的用途。

另一件事是,如果你不使用shell-execute来启动它们,那么有很多应用程序表现不佳。 首先尝试使用shell-execute(显然没有重定向任何std *),如果它以这种方式工作,那么你就会知道问题是什么 – 尽管我担心你无能为力。

另外,为什么这条线

 proc.StartInfo.RedirectStandardError = true; 

重复了两次?